Hướng dẫn quyết toán thuế năm 2025 theo công văn 564/TCS4-NVDTPC

Việc nắm vững quy định quyết toán thuế không chỉ giúp doanh nghiệp và cá nhân tuân thủ pháp luật mà còn tối ưu hóa quyền lợi về hoàn thuế hoặc miễn giảm. Nhất là khi quy trình quyết toán năm nay không chỉ siết chặt quy định về ngưỡng tạm nộp thuế TNDN mà còn cập nhật các mẫu biểu mới. Doanh nghiệp có thể xem hướng dẫn chi tiết về quyết toán thuế năm 2025 qua bài viết tại phần mềm kế toán EasyBooks dưới đây.

1. Quyết toán thuế là gì? Đối tượng phải thực hiện

Quyết toán thuế là quá trình cá nhân hoặc tổ chức kiểm tra, rà soát và xác định chính xác số thuế phải nộp (hoặc được hoàn, bù trừ) cho cơ quan thuế sau khi đã kê khai tạm nộp trong kỳ tính thuế, thường là năm dương lịch. Đây là thủ tục bắt buộc theo Luật Quản lý thuế 2019, nhằm đảm bảo tính chính xác của nghĩa vụ thuế từ thu nhập, kinh doanh hoặc tài sản. Đối tượng phải thực hiện bao gồm:

• Các cá nhân cư trú có thu nhập từ tiền lương, tiền công từ hai nơi trở lên nhưng không đủ điều kiện ủy quyền quyết toán cho tổ chức trả thu nhập thì phải tự quyết toán trực tiếp với cơ quan thuế.
• Cá nhân cư trú thuộc diện xét giảm thuế do thiên tai, hỏa hoạn, tai nạn hoặc bệnh hiểm nghèo cũng phải trực tiếp khai quyết toán, không được ủy quyền.
• Người nước ngoài kết thúc hợp đồng lao động tại Việt Nam phải quyết toán trước khi xuất cảnh (hoặc ủy quyền nếu chưa kịp).

2. Những điểm chính trong Công văn 564 về quyết toán thuế TNDN

Dưới đây là các điểm chính về quyết toán thuế Thu nhập doanh nghiệp (TNDN) dựa trên nội dung Công văn số 564/TCS4-NVDTPC:

Phạm vi khai quyết toán

Khai quyết toán thuế TNDN bao gồm: Khai quyết toán thuế năm và quyết toán đến thời điểm doanh nghiệp giải thể, phá sản, chấm dứt hoạt động, chấm dứt hợp đồng hoặc tổ chức lại doanh nghiệp.

Nghĩa vụ tạm nộp thuế quý

• Tự xác định: Doanh nghiệp tự xác định số thuế TNDN tạm nộp quý và được trừ số đã tạm nộp vào số phải nộp theo quyết toán năm.
• Ngưỡng tối thiểu: Tổng số thuế TNDN đã tạm nộp của 04 quý không được thấp hơn 80% số thuế phải nộp theo quyết toán năm.
• Tiền chậm nộp: Nếu nộp thiếu so với mức 80% nêu trên, doanh nghiệp phải nộp tiền chậm nộp tính trên số thuế thiếu.

Thời hạn và địa điểm nộp hồ sơ

• Thời hạn: Chậm nhất là ngày cuối cùng của tháng thứ 3 kể từ ngày kết thúc năm dương lịch hoặc năm tài chính. Nếu trùng ngày nghỉ, thời hạn được tính là ngày làm việc tiếp theo.
• Địa điểm: Tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp. Trường hợp có đơn vị phụ thuộc tại tỉnh khác thì nộp bảng phân bổ thuế cho cơ quan thuế quản lý trụ sở chính.

Hồ sơ khai quyết toán

• Phương pháp doanh thu trừ chi phí: Tờ khai mẫu 03/TNDN, Báo cáo tài chính năm và các phụ lục kèm theo (về kết quả kinh doanh, chuyển lỗ, ưu đãi thuế, phân bổ thuế…).
• Phương pháp tỷ lệ trên doanh thu: Tờ khai mẫu 04/TNDN và Báo cáo tài chính năm.
  • Lưu ý: Doanh nghiệp siêu nhỏ nộp thuế theo tỷ lệ % không bắt buộc lập báo cáo tài chính để nộp cho cơ quan thuế.

Quy định về Giao dịch liên kết

• Phải thực hiện kê khai các phụ lục theo Nghị định 20/2025/NĐ-CP (hiệu lực từ 27/03/2025) áp dụng cho kỳ tính thuế 2024 trở đi.
• Miễn lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết khi:
  • Chỉ phát sinh giao dịch với các bên liên kết cùng nộp thuế TNDN tại Việt Nam, cùng thuế suất và không bên nào hưởng ưu đãi.
  • Tổng doanh thu dưới 50 tỷ đồng và tổng giá trị giao dịch liên kết dưới 30 tỷ đồng.
  • Doanh nghiệp thực hiện chức năng đơn giản, doanh thu dưới 200 tỷ đồng và đạt tỷ suất lợi nhuận thuần quy định (Phân phối ≥ 5%, Sản xuất ≥ 10%, Gia công ≥ 15%).

Xem chi tiết: Quyết toán thuế TNDN

3. Những điểm chính trong Công văn 564 về quyết toán thuế TNCN

Dưới đây là những điểm chính trong Công văn 564 về quyết toán thuế TNCN:

Trách nhiệm của tổ chức, cá nhân trả thu nhập

• Khai quyết toán thuế: Phải thực hiện khai quyết toán thuế TNCN bất kể có phát sinh khấu trừ thuế hay không.
• Cấp chứng từ khấu trừ: Phải thực hiện cấp đầy đủ, kịp thời chứng từ khấu trừ thuế để cá nhân tự đi quyết toán trực tiếp với cơ quan thuế.
• Trường hợp đặc biệt: Nếu tổ chức trả thu nhập đã quyết toán thay cho cá nhân, sau đó phát hiện cá nhân thuộc diện phải trực tiếp quyết toán thì không điều chỉnh lại quyết toán của tổ chức mà chỉ cấp chứng từ khấu trừ thuế ghi chú rõ nội dung đã quyết toán thay.
• Hướng dẫn người lao động: Có trách nhiệm hướng dẫn các cá nhân không thuộc diện ủy quyền tìm hiểu quy định để tự thực hiện quyết toán đúng hạn, tránh bị xử lý vi phạm.

Trách nhiệm của cá nhân tự quyết toán

• Tự xác định nghĩa vụ: Cá nhân cư trú có thu nhập từ lương, công từ 02 nơi trở lên không đủ điều kiện ủy quyền phải trực tiếp khai quyết toán nếu có số thuế nộp thêm hoặc nộp thừa đề nghị hoàn/bù trừ.
• Kê khai đầy đủ: Khi tự quyết toán (mẫu 02/QTT-TNCN), phải ghi đầy đủ thông tin về các tổ chức trả thu nhập trong năm để cơ quan thuế có cơ sở giải quyết.
• Đăng ký người phụ thuộc: Nếu chưa thực hiện đăng ký người phụ thuộc trước đó thì phải nộp hồ sơ đăng ký khi quyết toán thuế.

Các lưu ý quan trọng về kỹ thuật và pháp lý

• Mã số thuế (MST): Các tổ chức chi trả phải đảm bảo 100% người nộp thuế được kê khai đầy đủ mã số thuế tại các bảng kê quyết toán.
• Ngưỡng nộp thêm: Cá nhân có số thuế TNCN phải nộp thêm sau quyết toán từ 50.000 đồng trở xuống thì được miễn thuế và không bắt buộc phải nộp hồ sơ quyết toán.
• Tiền chậm nộp TNDN: Tổng số thuế TNDN tạm nộp 04 quý không được thấp hơn 80% số thuế phải nộp cả năm; nếu thiếu sẽ bị tính tiền chậm nộp.
• Giao dịch liên kết: NNT có giao dịch liên kết phải lưu ý áp dụng các mẫu biểu theo Nghị định 20/2025/NĐ-CP cho kỳ tính thuế năm 2025.
• Khuyến khích công nghệ: Cơ quan Thuế khuyến khích NNT sử dụng hình thức khai và nộp thuế điện tử qua ứng dụng eTax Mobile hoặc cổng dịch vụ công.

Xem thêm: Hướng dẫn quyết toán thuế thu nhập cá nhân

4. Trách nhiệm và lưu ý quan trọng khi quyết toán thuế

Trong quá trình quyết toán thuế, các cá nhân và doanh nghiệp nên nắm được trách nhiệm và một số lưu ý quan trọng dưới đây: 

Việc chậm nộp hồ sơ hoặc nộp thiếu thuế theo quy định 80% (đối với TNDN) sẽ dẫn đến các khoản phạt chậm nộp không đáng có. Doanh nghiệp và cá nhân nên chủ động nắm bắt các hướng dẫn quyết toán thuế năm 2025 và thực hiện sớm trước thời hạn tháng 3/2026.

Đăng ký dùng thử phần mềm kế toán doanh nghiệp EasyBooks ngay hôm nay để quản lý sổ sách, hóa đơn và thực hiện quyết toán thuế TNDN nhanh chóng, chính xác; đồng thời chuẩn hóa dữ liệu kế toán, sẵn sàng cho kiểm toán và đối chiếu theo quy định.

ĐĂNG KÝ NHẬN TƯ VẤN VÀ DÙNG THỬ MIỄN PHÍ

Chọn sản phẩm quan tâm * Phần mềm kế toán doanh nghiệp Phần mềm kế toán dịch vụ Phần mềm kế toán hộ kinh doanh Phần mềm kế toán hành chính sự nghiệp Khác

ĐĂNG KÝ

Gửi thông tin thành công, Easybooks sẽ liên hệ sớm nhất đến với quý khách hàng!

Trên đây, EasyBooks đã giúp bạn tìm hiểu “Hướng dẫn quyết toán thuế năm 2025 theo công văn 564/TCS4-NVDTPC“. Hy vọng thông tin này hữu ích tới quý bạn đọc, từ đó nâng cao hiệu quả quản trị và phát triển bền vững.

———————————

EASYBOOKS – TỰ ĐỘNG HOÁ NGHIỆP VỤ KẾ TOÁN

• EasyBooks đáp ứng đầy đủ nghiệp vụ quản trị tài chính kế toán cho mọi doanh nghiệp theo thông tư 99/2025/TT-BTC,133/2016/TT-BTC và 152/2025/TT-BTC
• Đưa ra cảnh báo cho kế toán khi hạch toán không hợp lệ, tồn quỹ âm – kho âm và không tuân thủ các nguyên tắc kế toán.
• Tất cả tính năng và hệ thống báo cáo của phần mềm được xây dựng dựa trên quy chuẩn chung của Bộ Tài chính.
• EasyBooks nâng cấp ứng dụng MIỄN PHÍ khi có thay đổi về chính sách kế toán, thuế, nghị định, thông tư.
• Đánh giá hiệu quả kinh doanh chi tiết và tối giản thao tác, giảm thời gian nhập liệu chứng từ cho kế toán.

Liên hệ để được tư vấn về phần mềm kế toán

Hotline mua hàng: 0869 425 631

Zalo mua hàng: Zalo Easybooks

Facebook: Facebook phần mềm kế toán EasyBooks

Group trao đổi: Cộng đồng hỗ trợ Phần mềm kế toán EasyBooks – SOFTDREAMS

Trụ sở chính: Tầng 3, tòa nhà CT5AB, Khu đô thị Văn Khê, Phường Hà Đông, Thành phố Hà Nội, Việt Nam

Chi nhánh: Số H.54 đường Huỳnh Tấn Chùa, phường Đông Hưng Thuận, TP Hồ Chí Minh

Chia sẻ bài viết: